1959年 9月 中共山東省委宣傳部批準，創辦《山東海洋學院學報》，主編為赫崇本。
1959年10月《山東海洋學院學報》創刊號出版。
1960年 4月《山東海洋學院學報》1960年第1期發表了文圣常教授的論文“普遍風浪譜及其應用”和“涌浪譜”，受到國內外學術界的重視，后來被譽為“文氏譜”。
1962年11月 學校成立學報編輯部委員會（11人）。
主任委員: 許亮;副主任委員: 薛廷耀;主編: 赫崇本，
編委會委員：文圣常等9人。
1966年 1月《山東海洋學院學報》開始?？?。
1978年 6月《山東海洋學院學報》復刊。 組成新一屆編輯委員會。
編委會主任:赫崇本；編委會副主任:方宗熙文圣常
編委會委員：王彬華等10人
1979年 5月 經國家科委批準，《山東海洋學院學報》對國內外發行。
1981年 3月 學報編委會調整。主任委員：赫崇本；副主任委員：方崇煕、文圣常、薛廷耀；編委會委員：馮士筰等23人。
1986年 6月《山東海洋學院學報》編輯室改為編輯部，劉安國任編輯部主任。
1988年 1月 經國家教委批準，山東海洋學院改名為青島海洋大學。
1988年 9月《山東海洋學院學報》更名為《青島海洋大學學報（自然科學版）》。組成自然科學版編輯委員會（第四屆）。編委會主任：文圣常；
編委會副主任：李德尚、張正斌；主編：文圣常；副主編：劉安國；編委會委員：馮士筰等23人。
1992年12月《青島海洋大學學報（自然科學版）》被評為國家教委直屬高校優秀科技期刊。
1996年 4月《青島海洋大學學報（自然科學版）》第四屆編輯委員會成立。
編委會主任：文圣常；編委會副主任：管華詩、秦啟仁、李德尚、張正斌、劉安國。主編：文圣常；副主編：劉安國；
編委會委員：王寧35人等。
1997年 1月 嚴國光任《青島海洋大學學報（自然科學版）》編輯部主任，增補為常務副主編，第四屆編委會副主任。
2001年 1月《青島海洋大學學報（自然科學版）》改為雙月刊。
2001年 2月 李鳳岐任學報編輯部主任（兼）。
2001年10月 于衛任學報編輯部副主任（負責自然科學版）。
2004年 1月 青島海洋大學學報（自然科學版）更名為中國海洋大學學報（自然科學版）。
2005年 4月 學報自然科學版成立第五屆編委會.
編委會主任：管華詩；編委會副主任：馮士筰、李慶忠、吳德星、麥康森。主編：管華詩；常務副主編：于衛。
編委會委員：王寧等55人。
2005年 5月 鮑洪彤任學報編輯部主任。
2005年 8月 學報編輯部榮獲“中國高等學校自然科學學報研究會“高?？萍计诳冗M集體”稱號
2006年10月 學報榮獲教育部科技司“首屆中國高校精品科技期刊獎”。
2007年 7月 學報正式簽署協議加盟科學出版社，2008年正式實施。
2008年11月 學報榮獲教育部科技司“第二屆中國高校精品科技期刊獎”。
2009年10月 25日學報創刊50周年慶典大會在魚山校區舉行。校黨委書記于志剛、校長吳德星、學報主編管華詩、文圣常院士、中國高校學報研究會理事長顏帥等出席。
2010年 1月 學報由雙月刊改為月刊。
2010年10月 學報獲教育部科技司“第三屆中國高校精品科技期刊獎”。
2011年 8月 學報第六屆編委會成立。主編：馮士筰；常務副主編：劉秦玉；副主編：董雙林、李華軍、趙美訓；編委會委員：包振民等56人。
2011年 9月 龐旻任學報自然科學版編輯部主任。
2012年11月 學報榮獲教育部科技司“第四屆中國高校精品科技期刊獎”。
2013年12月 學報榮獲“2013中國國際影響力優秀學術期刊”。
2014年10月 學報獲教育部科技司“第五屆中國高校精品科技期刊獎”。
2014年12月 學報榮獲“2014中國國際影響力優秀學術期刊”。
2015年 9月 學報榮獲“2015期刊數字影響力100強（學術/科技類期刊）”。
2015年12月 學報榮獲“2015中國國際影響力優秀學術期刊”。
2016年 9月 學報榮獲“2016期刊數字影響力100強（學術/科技類期刊）”。
2016年10月 學報榮獲中國高?？萍计诳芯繒?/FONT>2016年度中國高校百佳科技期刊獎”。
2016年12月 學報榮獲“2016中國國際影響力優秀學術期刊”。
學報獲山東省高等學校學報研究會“山東省優秀科技期刊”獎
學報獲中國高?？萍计诳芯繒?/FONT>“中國高校百佳科技期刊”。
2019年5月 學報自然版第七屆編委會成立。主編：李華軍；常務副主編：陳顯堯，艾慶輝；編委會委員共計53人。
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